奥歯の根元が腫れる原因は、
1. 虫歯がひどく神経が以前取られていて根元に感染を起こした場合（感染根管）
2. 根元の間の根分岐部病変が出来、それが原因で腫れた場合
3. 歯周病急性発作で歯茎が腫れた場合
などが考えられます。
いずれの場合も、放置せずしっかり治療を行う必要があります。
1の感染根管の場合には、根管治療をします。
2の根分岐部病変は、腫れを繰り返すことが多く、難しい治療とされます。
3の歯周病急性発作は、慢性的な経過をたどる歯周病の症状が、一気に表に出る状態です。
歯の動揺と痛みを伴うことが多く、中程度以上の歯周病の場合にみられることがあります。
咬合調整や投薬で急性症状を抑えてから本格的に歯周病治療をします。